仙帝担心王飞虎知道内幕后，会带神兵进攻上古天宫，于是亲自用“噬魂大法”，趁王飞虎没有防备，轻易地让王飞虎失去了全部的记忆，又安排两位上古仙界大神，用轩辕剑毁其金身，当正准备毁掉王飞虎肉身的时候，一道金光将王飞虎的肉身卷走，两位上古仙界大神吓得瘫坐在地上，仙帝怕防止事件暴露，用轩辕剑将两位瘫在地上的仙界大神杀死，只说是私通嗜血魔皇的反叛之神，由他亲自正法。

经过上古异界大战，仙帝统一了三界，并掌管了三界数万年，因为没有了王飞虎这样的竞争对手，仙帝感到厌倦了三界的管理，将三界的管理交给了外孙，也就是玉皇大帝，玉皇大帝重建了一座天宫，带走了大部分的上古仙界大神，仙帝身边仅留下几个护法天王和一些上古仙界大神，以及一些天兵天将护卫着上古天宫的安全。

千年万载定轮回，嗜血魔皇和八大魔王又到了轮回的劫数，仙帝故意派出两位上古仙界大神救出嗜血魔皇和八大魔王，时刻掌握着他们的一举一动。

异界霸主王飞虎也投胎到了人间太行山，也就是现在的王小虎。仙帝经过了数万年的修炼，意境已经超然，变得有些仁慈，但依旧暗中操控着三界。

仙帝命火麒麟将异界重建，又担心他将上古异界大战的秘密泄露出去，于是想办法要杀火麒麟，又暗中关注着王小虎的成长和发展，并要玉皇大帝派陆吾大仙协助王小虎恢复神功。

仙帝在长山岛上空看到刘玉兰为了王小虎的安危，竟然用血肉之躯挡住火系魔王的鬼火，他大受感动，亲自为这个痴情的人间女子疗伤并用上古青鸾火凤的灵魄附在她身躯内，让她浴火重生。

当王小虎带着刘玉凤来到上古天宫的那一瞬间，仙帝的心情万分的复杂，一看到王小虎，让他有一种愧疚之感；当听到王小虎告诉他，嗜血魔皇在苦叶岛有近十万魔兵的时候，他又想到用王小虎的神兵和嗜血魔皇的魔兵相互制约和相互牵制，想达到一种平衡，因此安排一名护法天王阻止和拖延王小虎进攻苦叶岛的时间。

直到苦叶岛神魔大战以后，仙帝才发现这种相互牵制是错误的，又故意让假意投靠嗜血魔皇的两位仙界大神，利用救李元彪的恩惠，让两位仙界大神又来假意投靠王小虎，不曾想被王小虎一眼看破，两位仙界大神只得返回仙帝的身边。

仙帝为假意全面支持王小虎消灭嗜血魔皇和其手下魔兵，又派出一位护法天王到苦叶岛找王小虎，建议合作进攻嗜血魔皇，并想在王小虎和嗜血魔皇神魔大战两败俱伤之时，来坐收渔翁之利，并想收回《无字天书》，想用它来封印王小虎和异界的大神，不想让异界神殿真正的崛起。

仙帝这一次的策略又失误了，他以为王小虎没恢复记忆，对上辈子的事一无所知，他那里知道，王小虎第二次神墓岛之行，已经将上辈子的一切秘密全都了然于心。

王小虎故意答应仙帝合作共同灭掉嗜血魔皇之约，暗中让朱雀带领一万神兵来到人间，躲在苦叶岛白虎神设置的结界之中。

为了大战的胜利，青龙大法王和虎蛟大神亲自带领神兵进行排兵布阵的训练，白虎神负责苦叶岛的警戒工作，王小虎和刘玉凤也天天练功，不敢有一丝的侥幸的心理，不但要全部杀死嗜血魔皇及其魔兵，更重要的是防止仙帝趁火打劫，将异界神殿再一次推往深渊。