不过曹越这样行事，却引起了原南京镇军将领的不满。

曹越此举，差不多就是准备将南京原镇军解散，全部换上新募集的人马。南京原有镇军只有五万兵额，实际人数至多三万，另外两万名额是用来领空饷的，但这三万将士也不是一个小数目，原有的将领可是将麾下的兵马当作自己的资本，他们把自己手下的兵马当依仗，也把这些兵马当作自己利益的来源。现在曹越这样做，差不多就是断了他们的根本，他们当然非常不满。

也就在曹越颁布了募兵令后，南京镇军中原来那些领军将领表示了强烈的不满，许多将领联合起来，一道找曹越抗议，甚至有人想以武力相对抗。但对此早就想到，并有了预案的曹越，马上做出了应对。从大同带过来的火枪营，还有不对外公开的改名为特卫营的特种集训队，是曹越胆敢这样行事的最大资本，也就在这些将领准备闹事并想武力对付曹越的时候，曹越先下手为强了。

第一火枪营的将士和特种集训队及康斯丁的雇佣军全部出动，几乎不废吹灰之力就控制了南京所有的军营。曹越早已经打探清楚了南京镇军的情况，这些人马，比北京京营的战斗力还要差，可以说是乌合之众中的乌合之众，欺侮百姓他们可以做到，但要他们上战场打仗，那无异于羊入虎口，面对训练有素的火枪营及特卫营的强大武力威胁，这些人马，只有放下武器投降的份。

特卫营在第一时间就将大部分的领军将领拿下，原本就没什么战斗力的南京镇军，怎么可能挡的住曹越带过来火枪营的镇压？很快，在没闹出什么大的动静下，曹越就将南京镇军全部镇服，主要将领都扣押，所有人马都被控制在军营中。

随后曹越就对南京镇军进行了整顿，体质不错，无劣迹的军士，如果想留在新军中也可，但并不强求。那些体质、品行差的军士，只有被清退的份，给了五两银子的安家费后，就从南京镇军中清退。

有了不错的安家费用，被清除的军士也没太多怨言，有怨言的军官或者军士都得了教训，再不敢去惹什么麻烦。

清退工作完成后，原三万南京镇军，最终只留下八千人。曹越将这八千人，与火枪营将士进行了混编，组成了南京新军第一、第二、第三营，开始训练的同时，也负责起南京的日常防卫。

对曹越做出的如此大的动作，南京的官场出奇的没有激烈反对的声音，官员们不是默许，就是或明或暗的支持。这都是因为曹越掌握了官员们太多见不得人的东西，以此当作要胁，那些被曹越掌握了短处的官员，在自己利益没受到大的损失前提下，也不愿意站出来反对曹越。

毕竟曹越拿捏着他们的痛处，又是奉皇命练兵，可以便宜行事。更重要的是，曹越手上还有皇帝所赐的尚方宝剑，可先斩后奏。大同那位吴姓副总兵，被曹越砍了头，最终曹越什么事情都没有。虽然说他们和那位吴姓总兵身份不一样，但谁知道恃宠而骄的曹越，会不会做出让人无法想象的事呢？

这情况，史可法是做梦都没想到过。

他没曹越会以这样的方式开始履行职责，他也想不到，户部尚书高弘图会慷慨地拿出所存不多的钱粮让曹越使用，并且南京的权贵和官员们不约而同地自愿捐赠钱粮，供曹越练兵。他也想不到，曹越会用这样强硬，甚至以武力相威胁，解散了原南京镇军，将南京镇军全部换上了自己的人马。

史可法对曹越的看法，几乎每天都在改变，他不得不惊叹，这是一个没办法用常理去想象的人，是一个天不怕地不怕，什么人都敢得罪的胆大到敢包天的家伙。与史可法有着同样想法的官员很多，几乎所有南京官员，都对曹越这个新任的南京提督刮目相看了!