荷兰人短暂的停留了一段时间之后便急着赶回去搬救兵了，他们一路南下在南中国海遇到了北上的荷兰人援军，荷兰人汇合之后便马不停蹄的向北疾驰，比施琅和赫本预设的时间早了一个月抵达了广东和福建一带的海域，双方约定好了进攻时间，为了麻痹台湾的明军，荷兰人还特地向东行驶了一段时间，给明军造成了荷兰人是奔着台湾而来的，其实这个时候清军已经将台湾城被攻破的消息告诉了荷兰人，既然台湾城已经失守了，那么这个时候再去台湾就显得不那么明智了，明军肯定会严阵以待，荷兰人不一定有机会击败明军抢回台湾岛，既然如此干嘛不将水搅浑，打乱明军的部署，调动明军的水军出击，然后联合清军击败明军再行收复台湾呢？

荷兰人的突然出现并且带着一只不容小觑的舰队，这令金门岛上的明军大为震动，这个时候即使加上澎湖方向来的水军，明军海面上的力量仍然显得捉襟见肘，郑经甚至已经做好了弃军出逃的准备，甚至命人将自己的财产和陈氏都送上船去，准备逃跑。

虽然最后经陈永华发现并且力劝之下，郑经最终没能逃跑成功，但是他的这番举动却没能隐瞒成功，消息很快便传遍了整个明军，明军将士一片哗然，自己的主将竟然要抛下大军自己逃跑，士兵们议论纷纷，士气也受了很大的影响。

这个时候明军面对的局势十分不妙，清军的陆上大军已经休整完毕，正要跨海登陆，海上的明军要被一分为二，同时被清军和荷兰人牵扯，加上明军的军心不定，这一仗还没有开打就已经没有什么悬念了。

清军在七月六号这天向金门岛的北边发起猛烈的进攻，海山遮天蔽日全都是清军和明军的战船，海战场面极为惨烈，双方皆死战不退，将一颗颗炮弹倾泻到对方阵型中去，双方皆死伤惨重，大型福船的抗沉性比较一般，没有西方人船只上面的水密舱，加上体积庞大刚一开战双方前面的几艘战船几乎同时伤痕累累，木制战船在进入火器时代之后在海战中更加容易着火，清明两军的战船还在不断的靠近，双方都是排成一个雁阵，前面的战船这个时候都受损严重，冒出浓浓的黑烟，船上一片混乱，四处都是哭天抢地的士兵，有的正在奋力灭火，有的已经弃船跳海，火势渐渐失控，一处火线点燃了裸露在甲板上的火药桶，发出了巨大的爆炸爆炸声，将数十名士兵掀飞起来。

双方大军像是没有看见同袍的惨状一般，不顾一切的向前、向前，直到双方都到了炮击的距离上，又同时怒吼着将炮火向对方抛去。

明军集中了主要的兵力在北面的海域，主要是因为荷兰人的船只数量要比清军少得多，而且荷兰人船上的陆军数量比较少，即使登陆了也不会对明军造成非常大的冲击，明军的战力倾斜使得荷兰人的进攻开展的异常顺利，荷兰人迅速击败了南部明军的水军，然后并没有派军队登陆，而是立刻北上从后方对明军的水军造成夹击。

明军的雁阵背后是最脆弱的地方，即使这个时候已经得到岛上传来的警告，黄庭也已经无法及时调整队形迎战荷兰人，他只有不顾一切的向清军进攻，意图在荷兰人抵达战场之前能够从正面击溃清军。